Para habilitar o Serviço de Manifestação de CT-e deve-se acessar o Controlador Hermes, na aba Informações Serviços, selecionar Manifestação de CT-e e clicar em 
Abrirá a tela de configurações, que deverá ser preenchida conforme instruções abaixo descritas:
- Intervalo Entre as Execuções: informar o intervalo de tempo que o serviço será executado. O tempo mínimo que pode ser definido é de 30 segundos.
- Horário de Execução: definição do período que o serviço será executado, respeitando o tempo de intervalo entre as execuções.
- Executar Automaticamente Quando Servidor for Iniciado: parâmetro que define se o serviço deve ser iniciado sempre que o Servidor Hermes for iniciado.
- Usuário: deve-se indicar um usuário para gravar nas tabelas de log. Esta informação não afetará em nada o funcionamento ou quaisquer outras funções deste usuário.
Clique em 
para salvar as configurações e sair da tela.
Clique em 
para não salvar as configurações e sair da tela.
Após configurado o serviço, na tela principal do Controlador Hermes, clique em 
para verificar se todas as configurações estão corretas.
Clique em 
para ativar o serviço. Caso a opção Executar Automaticamente Quando Servidor for Iniciado estiver desmarcada, ao reiniciar o Servidor Hermes, o serviço ficará desativado.
Clique em 
para desativar o serviço. Caso a opção Executar Automaticamente Quando Servidor for Iniciado estiver marcada, ao reiniciar o Servidor Hermes, o serviço ficará ativado.
Clique em 
para forçar a execução do serviço, independente do intervalo e do horário de execução.